Kapittel 2: DNA, RNA og proteiner

Det sentrale dogma

Det sentrale dogma i molekylærbiologi er at DNA transkriberes til RNA som så transleres til proteiner.

Epigenetikk

Denne veratasium-videoen er interessant, og de snakker masse om epigenetikk i eukaryoter.
Den følgende videoen er der veratasium har tatt illustrasjonene sine fra: Anbefaler denne for visualisering av epigenetikk i eukaryoter. Den inneholder blant annet en fantastisk illustrasjon av histoner rundt 1 min.

Epigenetikk er informasjon som er lagret i celler som ikke er den “digitale” koden vi finner i DNA eller RNA-sekvenser. Det er kjemiske og strukturelle faktorer som påvirker hvilke gener som uttrykkes. Epigenetikk er arvelig.

I eukaryoter brukes histoner, metylering, nukleosom-remodellering og RNA-assosiert demping. Se figur 2.13 på side 47 i boka.

Histoner (danner nukleosomer)

Histoner er en type proteiner som DNA kveiler seg rundt. De eksisterer bare i eukaryotiske celler, og er med på å bestemme om en celle er differensiert eller ikke. Strukturen av DNA kveilet rundt en gruppe histoner kalles et nukleosom.

Histoner har også “haler” som er proteiner som kan justeres av spesielle enzymer (HATs og HDACs). De kan enten være i “løs modus” der nukleosomet er løst bundet og DNA dermed er nokså lett tilgjengelig for uttrykking, eller fast bundet.

Metylering

Metylering er tilsetting av metylgrupper på DNAet. Metylering brukes til å stilne gener, og er veldig presist.

Nukleosom-remodelering

Nukleosom-remodellering er at noen enzymer kan skyve histoner, fjerne histoner og sette sammen nye histoner for å endre på epigenetikken. Jeg skjønner ikke helt hvorfor dette skal ha sitt eget punkt og ikke står under histoner.

Eksempel på RNA-associated silencing: X-inaktivering

Merk: forutsetter at videoen fra WEHImovies er sett.
Som kjent er X-inaktivering viktig for at kvinner skal uttrykke like mye av genene på x-kromosomet som menn. Dette skjer på en noe kontraintuitiv måte:
Det ene X-kromosomet metyleres på en spesifikk plass. Det andre X-kromosomet uttrykker et RNA som kalles Xist fra dette genet. Xist dekker til og inaktiverer hele X-kromosomet som produserer Xist.